Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC85BQ15834 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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