Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SEC23AQ15436 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SEC23AQ15436 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SEC23AQ15436 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SEC23AQ15436 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEC23AQ15436 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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