Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEMA3AQ14563 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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