Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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