Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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CBX3Q13185 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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