Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms