Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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