Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
J3KRW8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
J3KRW8 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
J3KRW8 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
J3KRW8 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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