Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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