Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms