Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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LAMA3Q16787 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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LAMA3Q16787 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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LAMA3Q16787 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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