Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK5Q16478 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms