Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms