Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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