Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRKQ15262 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
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PTPRKQ15262 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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PTPRKQ15262 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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PTPRKQ15262 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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