Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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