Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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