Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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