Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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