Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CUL1Q13616 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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