Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms