Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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