Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDE3BQ13370 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDE3BQ13370 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms