Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CENPFP49454 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CENPFP49454 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CENPFP49454 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CENPFP49454 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms