Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms