Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms