Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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