Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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