Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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RPE65Q16518 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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RPE65Q16518 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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RPE65Q16518 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPE65Q16518 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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