Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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