Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms