Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SYCP1Q15431 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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