Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EEA1Q15075 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
EEA1Q15075 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms