Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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