Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms