Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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CUL1Q13616 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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CUL1Q13616 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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CUL1Q13616 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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CUL1Q13616 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL1Q13616 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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