Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATMQ13315 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATMQ13315 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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