Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NME3Q13232 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms