Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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CBX3Q13185 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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CBX3Q13185 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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CBX3Q13185 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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CBX3Q13185 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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CBX3Q13185 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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