Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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