Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECH1Q13011 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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