Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFFO1Q0D2I5 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms