Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms