Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPRMP28827 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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PTPRMP28827 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PTPRMP28827 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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PTPRMP28827 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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PTPRMP28827 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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