Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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HOXC10Q9NYD6 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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HOXC10Q9NYD6 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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HOXC10Q9NYD6 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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HOXC10Q9NYD6 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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HOXC10Q9NYD6 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXC10Q9NYD6 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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