Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms