Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms