Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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