Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF239Q16600 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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