Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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